「バイオインフォマティクス」の記事一覧

PyRosettaによるエネルギー最小化とロゼッタスコアの出力【タンパク質】【In silico創薬】

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【シングルセル】Signacを用いたsingle-cell ATAC-Seq 解析のやり方【Seurat】 

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【シングルセル】Harmonyを使ったSingle Cell RNA-seqデータのバッチエフェクトの補正【Single Cell RNA-seq】

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【in silico 創薬】Dockstringによるコードのみでのin silico screening【in silico screening】

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【シングルセル】Scanpyを用いて各クラスターに自動で細胞種を割り当てる【scRNA-seq】 

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【シングルセル】Single Cell RNA-seqデータを用いた疑似バルクRNA-seq解析を行う方法【pseudo bulk analysis】

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【毒性予測】 VenomPred 2.0を用いた毒性予測【in silico創薬】

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【ゲノム解析】WGS/WES解析のこと始め【バイオインフォマティクス】

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【ポケット探索】CASTpを使ったタンパク質結合サイトの探索【in silico創薬】

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プベルル酸の毒性予測と治療薬への可能性の模索【in silico創薬】【ligand-based screening】

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【AI創薬】【毒性予測】 Toxicophores、QSARを用いた毒性予測【in silico創薬】

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【物性評価】 SwissADMEを使って物性を予測しよう【in silico創薬】

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【分子ドッキング】 SwissDockを使ったタンパク質-低分子ドッキング【in silico創薬】

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【機械学習】機械学習を用いたin silico screening【AI創薬】~第5/5 章 候補化合物のin silico screening~

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【機械学習】機械学習を用いたin silico screening【AI創薬】~第4/5 章 予測モデルの作成~

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【機械学習】機械学習を用いたin silico screening【AI創薬】~第3/5 章 機械学習データの整形~

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【RNA-seq】RaNA-seqを用いたRNA-seq発現量の定量【バイオインフォマティクス】

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【機械学習】機械学習を用いたin silico screening【AI創薬】~第2/5章 スクレイピングによる公共データベース（PDB)からの機械学習データを収集~

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【機械学習】機械学習を用いたin silico screening【AI創薬】~第1章 公共データベース（ChMBL)からの機械学習の学習データを収集~

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【ネットワーク解析】CytoscapeのstringAppを使って、タンパク質間相互作用ネットワーク解析を行う【Cytoscape】

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