「シングルセル」の記事一覧

DGIdbによる変動遺伝子からの薬物候補化合物の探索【Cytoscape】【in silico創薬】【RNA seq】【scRNA seq】

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【シングルセル】RNA Velocity解析のためのvelocytoを用いたloomファイルの作成【scVelo】

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【シングルセル】10x Genomics Cell Rangerからの出力ファイルを使ってTrajectory解析をする方法【Monocle3】

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【シングルセル】Monocle3を用いたTrajectory解析のやり方【擬似時間解析】

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【シングルセル】scVeloを用いたRNA Velocity解析のやり方【細胞状態遷移】

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【Monocle3】Rのパッケージ管理renvとバージョン管理rigを入れてTrajectory解析環境を構築する【シングルセル】

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【シングルセル】空間トランスクリプトーム解析の始め方【Scanpy】

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【シングルセル】Signacを用いたsingle-cell ATAC-Seq 解析のやり方【Seurat】 

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【シングルセル】Harmonyを使ったSingle Cell RNA-seqデータのバッチエフェクトの補正【Single Cell RNA-seq】

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【シングルセル】Scanpyを用いて各クラスターに自動で細胞種を割り当てる【scRNA-seq】 

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【シングルセル】Single Cell RNA-seqデータを用いた疑似バルクRNA-seq解析を行う方法【pseudo bulk analysis】

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【scRNA-seq】scRNA-seqデータセットを結合する方法【Seurat】

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【scRNA-seq】SeuratでscRNA-seqデータのマーカー遺伝子を特定する方法【Seurat】

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【scRNA-seq】Seuratで複数のscRNA-seqデータを統合してコントロール群と刺激群を比較する【Seurat】

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【Cell Ranger】NCBI SRA データをCell Ranger用に準備する方法【scRNA-seq】

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【scRNA-seq】DoubletFinderによるscRNA-seqのダブレット検出【バイオインフォマティクス】

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【バイオインフォマティクス】Cell Rangerを使ってscRNA-seqデータの遺伝子発現量をカウントする【scRNA-seq】

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【バイオインフォマティクス】CellBenderでSingle Cell RNA-seqデータのノイズ除去を行う【scRNA-seq】

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【バイオインフォマティクス】Seuratを用いて各クラスターに自動で細胞種を割り当てる【scRNA-seq】 

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【scRNA-seq】single cell RNA-seqデータを公共データから探す方法【バイオインフォマティクス】 

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