FEgrowを用いたアクティブラーニングによる化合物スクリーニングの高速化【In silico創薬】

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Boltzを使ったタンパク質構造とリガンド複合体の予測【タンパク質デザイン】【分子ドッキング】

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Pharmitを使ったファーママコフォア類似検索による新薬候補の発見【In silico創薬】

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PRODIGYを用いた環状ペプチド-タンパク質結合エネルギーの予測【In silico創薬】

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【タンパク質準備】OpenMMを使ったタンパク質のエネルギー最小化とPymolを使ったGrid boxの決定方法【In silico創薬】

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【Network pharmacology】タンパク質相互作用ネットワークの構築と重要タンパク質の発見【in silico 創薬】【Cytoscape】

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【Network pharmacology】Interveneを用いた漢方成分と疾患の共通標的の発見【in silico創薬】

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【Network pharmacology】Open Targetsを用いた疾患からの標的タンパク質の予測【In silico創薬】

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【Network pharmacology】化合物からの標的タンパク質予測【in silico 創薬】

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【Network pharmacology】PubChemを用いた漢方成分の抽出【In silico創薬】

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【in silico 創薬】Autodock CrankPepによる環状ペプチドの分子ドッキング【in silico screening】

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【GROMACS】金属イオンを含む標的へタンパク質へのMD設定 【in silico創薬】

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【GROMACS】Umbrella samplingによるMD simulation 【In silico創薬】【SMD】

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RNAfold Web Serverによるアプタマー二次構造予測【in silico創薬】

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Alphafold Analysisによるタンパク質の分析【タンパク質デザイン】【タンパク質モデリング】

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【タンパク質モデリング】NanobodyBuilder2によるVHH抗体のモデリング【in silico創薬】

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【タンパク質モデリング】ABodyBuilder2による抗体のモデリング【in silico創薬】

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【タンパク質デザイン】OSPREY 3.0を使ったタンパク質再設計

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【抗体デザイン】Protein-solによる抗体の特性解析【In silico創薬】

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PoseViewを用いたタンパク質-リガンド相互作用の可視化

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